主动脉瓣疾病的病理生理研究(五)
2018/8/1 17:15:11 医学论坛网
导语
由于目前尚无有效的药物治疗方法,CAVD给临床和经济带来了沉重的负担。
作者:沿若
来源:医学论坛网心血管
钙化主动脉瓣疾病(CAVD)疗法合集分析
在瓣膜蛋白组数据中所包含的丰富信息最好通过通路和网络分析来加以利用,从而使我们能够研究促进钙化主动脉瓣疾病的潜在全球患病情况。为了突出这些富集途径所代表的生物过程的共享蛋白质,我们构建了网络通路。这些通路可以提供涉及到CAVD的多个过程的全局视图,在这些过程中,由于它们之间的紧密联系,类似的通路集群自然地出现,使我们能够在每个阶段或层中收集主要的生物主题。我们选择将通路网络分析的重点放在钙化阶段和病变纤维膜层上,研究最先进的疾病表型。
CAVD疾病进展的标志是平滑肌细胞活化、炎性化和钙化相关通路的出现
我们首先确定了上述病发阶段中过度表达的蛋白的富集途径(图2仅在线数据补充)。在非病变期蛋白组分析中,有126条显著富集(q< 0.05)通路,在纤维化期蛋白组为169条,在钙化期蛋白组为122条(图3A);整个路径列表的在线数据补充见表III和图IX)。纤维化阶段的识别路径包括与肌纤维细胞活化(如平滑肌收缩)、囊泡转运、整合素信号和氧化应激相关的通路(图3A、图九和表三)。在钙化期的122个通路中,有免疫系统-、脂质-、整合素-、MAPK (mitogen-activated protein kinase)信号转导-、类视黄醇-和囊泡相关通路,所有这些通路都是已知的心血管钙化的诱因(图3A)。
图3。钙化主动脉瓣疾病(CAVD)分期及CAVD层功能分析。从蛋白质组学数据(n=9供者)中获得的非病变(ND, green),纤维化(F,品红色)和钙化(C, cyan)的通路显著丰富(q<0.05)。所选的路径为非病变、纤维化和钙化阶段列出(完整的路径列表可在仅在线数据补充图IX和仅在线数据补充表III中找到)。B,从蛋白组数据(n=3个腔隙主动脉瓣供体)中获得的纤维层(红色)、松质层(橙色)和心室肌层(蓝色)中显著富集的通路(q<0.05)。3层列出了选定的路径(完整的路径列表在仅在线的数据补充图XI和仅在线的数据补充表IV)。
接下来,专注于最先进的CAVD阶段---钙化的阶段,我们通过整合在一个网络通路相互连接到基于反映在蛋白质组学测量中共享蛋白质的数量,调查其关系路径(图九)。对于钙化阶段富集的通路,该网络显示了6个不同的通路簇(图X)。通过检查这些紧密相连的星系团,可以推断潜在的生物过程。例如,MAPK信号簇或子网络基于参与MAPK家族信号级联的通路的存在(仅在线数据补充图X),而补体簇包含了补体级联。因此,整个网络可以描述为包含以下子网络:(1)MAPK信号,(2)脂质代谢,(3)凝血,(4)补体系统,(5)炎症,(6)ECM。因此,丰富通路的网络表征为我们提供了一个关于潜在机制的简明概述。
参考文献:
1.Arda Halu,et al.Spatiotemporal Multi-Omics Mapping Generates a Molecular Atlas of the Aortic Valve and Reveals Networks Driving Disease
↓长按识别关注↓
医学论坛网心血管
cmt-xxg
↑长按ID复制↑
汇集心内科系列精品资料,心血管医生进阶必备。临床起点,欢迎关注~
医学论坛网
cmt_1999
长按识别左边二维码关注我们
授权微信:cmtwnys
商务合作QQ:1425551469
关注医学论坛网微信号,回复以下关键字,即可接收最新文章及科研进展
心血管 | 肿瘤 | 糖尿病
内分泌 | 神经 | 感染
妇产科 | 儿科
全科医学 | 医学人文
.....
底部请随手点赞哟↓↓
http://weixin.100md.com
返回 医学论坛网 返回首页 返回百拇医药