柳叶刀:香港疫情出现仓鼠传人,论文作者独家回应
2022/4/14 7:30:00 丁香园

     2022 年 3 月 12 日,柳叶刀发布一篇题为 Transmission of SARS-CoV-2 delta variant (AY.127) from pet hamsters to humans, leading to onward human-to-human transmission: a case study 的论文,首次报告了仓鼠传播新冠给人的病例。

    

     图源:The Lancet

     2022 年 1 月 15 日,香港一宠物店中的店员和顾客均感染了新冠病毒,同时该宠物店仓鼠的新冠病毒检测样本呈阳性,均为 Delta 毒株。

     而此前从 2021 年 10 月 9 日开始,香港疫情中已经没有 Delta 毒株感染病例了,取而代之的是 2021 年 12 月 24 日开始出现的 Omicron 毒株本土疫情。

     研究人员从这家宠物店及其仓库的动物身上,收集了病毒拭子和血液样本;又在与宠物店有流行病学联系的感染者以及随后确诊的当地病例身上,收集了鼻拭子或唾液样本。

     调查结果表明,在香港此次疫情中,感染者和感染仓鼠体内存在的病毒基因组,此前未在当地传播。据推断,这些仓鼠的感染时间是 2021 年 10 月 14 日左右。同时,发现了不止一条从宠物仓鼠到人类的病毒传播链。

     文章的结论是,新冠病毒可以被仓鼠自然感染,可以在仓鼠之间传播,并导致人类感染。

     在香港的第五波疫情中,虽然 Omicron 占主流,但也存在一小部分 Delta。感染仓鼠的进口,可能是香港这部分 Delta 毒株引起的疫情的根源。

     不过,该研究也提及了 2 个局限性:首先,未能对相关宠物店和仓库中的全部仓鼠进行研究,因为在调查之前出售的仓鼠无法追溯,因此可能低估了该仓鼠种群中的病毒多样性;此外,也不能排除新冠病毒的本土传播导致仓鼠感染的可能性,尽管这个可能性很小。

     2022 年 4 月 13 日,论文作者之一、香港大学公共卫生学院博士后 顾豪高(Haogao Gu, PhD)对研究作出回应及补充。丁香园获授权发布全文如下:

     我是这篇文章的作者之一,主要负责分析测序数据。

     在仓鼠店发现了 Delta (AY.127) 的传播链之后,我的同事们在香港渔护署的帮助下,到宠物店现场以及动物仓库采集了大量样本并进行了实验。

     实验包括检测环境和动物样本上面有没有病毒核酸,以及检测动物的血液里面有没有以往曾经感染的痕迹等。

     对于病毒核酸阳性的样本,我们尝试进行测序以分析潜在的传播关系。

     来讲讲这几点:

     1、仓鼠能不能传人?

     叙利亚仓鼠(Syrian hamsters)(学名,并非来自叙利亚的仓鼠)可以将病毒传染给人类。在这次香港的仓鼠传播链里面,我们首先在一个宠物店员工和两个宠物店顾客身上发现 Delta 病毒株感染。

     测序结果发现员工和顾客很可能并非互相传染,反而是由两个不同的源头导致的 (可能是两次独立的仓鼠传人)。

     我们不但在宠物店里面的叙利亚仓鼠检测出病毒,在市郊动物仓库里面的叙利亚仓鼠也发现了大量感染,其中有一部分还是是既往感染(血清有抗体)。

     仓鼠的患病时间比患者早,而且早期病例均未到访动物仓库但都有仓鼠接触史,后来在其他的宠物店里面(患者未到访)也发现了阳性仓鼠和阳性环境样本(文中未提及)。

     测序结果发现仓鼠群体里面的病毒多样性更高,而且在进化上更符合两次传人的假设。

     以上证据符合香港的进口仓鼠里面有大规模的感染,病毒在内部经历了传播进化,然后在人类接触它们过后,发生了不少于两次的动物到人的传播。

     2、发生了多少次仓鼠传人?

     文中提及的至少两次, 后续监测表明可能大于两次。

     后续我们又发现了一些香港本地的 AY.127 病例(例如下面引用的报道里面的 17 岁学生),他们与不是由之前的患者传播,也暂时没有找到相似的序列(推断可能是来自于前一个批次的仓鼠,或一些已康复的但由于病毒量低无法获得序列的仓鼠)。

     但是这些病例全部带有之前在仓鼠传播链上面发现的特有的突变(如 Spike D427G),提示它们的最终源头,还是和仓鼠有关。

    

     顾豪高引用香港报道

     3、后续能否人传人?

     可以。

     4、其他动物能不能传人?

     在香港只发现了叙利亚仓鼠传人。

     5、病毒传染力/致病力改变?

     在香港本地的仓鼠相关序列有一些特征突变, 在全球别的序列罕有的,但是我们现在还没有实验证据去说明它们改变来病毒的传染力/致病力。

     上述突变包括:

    

     6、仓鼠在哪里感染的病毒?

     香港的这批动物都是进口的,我们没有找到 100% 相似的序列,能找到的最相似的序列(仍有一些不同,说明没有直接传播)来自欧洲。病毒有可能在到香港之前,在仓鼠群体里面,已经进化了一段时间了。

     策划:z_popeye

     监制:gyouza

     题图来源:视觉中国

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