北京大学伊成器实验室招聘博士后(附伊成器教授专访)
2019/3/21 8:29:35学术经纬 学术经纬
▎学术经纬/报道
北京大学伊成器实验室依托北京大学生命学院、北大-清华生命科学联合中心以及北京大学合成与功能生物分子中心,通过化学生物学、细胞生物学、高通量测序等手段,对RNA/DNA表观遗传修饰的生物功能及其调控机制进行研究。现招聘着丝粒(centromere)生物学和RNA生物学等方向的博士后2-3名。
更多介绍请见伊成器实验室主页http://yi-lab.org/。
一、着丝粒生物学方向
1. 着丝粒生物学相关专业背景,具有博士学位(已毕业或应届毕业生);
2. 在本专业领域主流国际期刊以通讯作者或者第一作者发表过高水平研究论文,可以独立开展科研工作;
3. 有较强的团队合作能力和创新进取精神。能适应多课题、快节奏的工作环境。
4. 具有较强的英文写作与交流的能力。
二、RNA生物学方向
1. RNA生物学生物相关专业背景,具有博士学位(已毕业或应届毕业生);
2. 在本专业领域主流国际期刊以通讯作者或者第一作者发表过高水平研究论文,可以独立开展科研工作;
3. 有较强的团队合作能力和创新进取精神。能适应多课题、快节奏的工作环境。
4. 具有较强的英文写作与交流的能力。
【待遇条件】
在北京大学博士后管理相关规定基础上提供有市场竞争性待遇条件。在博士期间或入站后做出优秀研究成果的申请人可协助申请“北大博雅博士后基金”和“北大-清华生命中心博士后基金”等资助,入选者除了享受北京大学博士后的基本待遇之外,由上述机构补贴与国际水平相当的薪资奖金。
【申请材料】
详细的个人简历和主要研究成果介绍(包括代表性论文及其摘要),及至少2名推荐人(包括博士导师)的联系信息。
【联系方式】
请将申请材料发至chengqi.yi@pku.edu.cn
探索表观转录组学的新大陆——专访北大80后博导伊成器博士
原文发表于2017年4月
打开互联网,电脑屏幕上会有无数多媒体信息迅速映入你的眼帘:看似轻松的浏览,背后却是浩繁计算机代码到人类语言符号的复杂转换。其实在人体细胞深处,从生命密码DNA到蛋白质的最终合成,同样包含了无数精密的转录和翻译程序:每一个调控机制的毫厘偏差,都会使最终的结果失之千里;既意味着致病的风险,也可能蕴藏着重大疾患的治愈曙光。
▲伊成器博士
随着人类基因组工程项目的结束,以RNA转录产物的化学修饰为研究对象的表观转录组学,也成为一门崭新的生物学分支。2016年,表观转录组分析更是荣膺Nature Methods年度技术。作为中国学者在这门新兴学科领域的杰出代表,北大博导伊成器博士的主要学术方向就是通过化学生物学和高通量测序等手段,研究核酸修饰的生物功能及其生理调控机制。他的团队已顺利鉴定全转录组水平m1A可逆RNA修饰谱图、并绘制了人和小鼠细胞转录组假尿嘧啶RNA修饰的谱图。此外,他的团队也绘制抗癌药顺铂与DNA结合位点全基因组图谱等。
出生于1983年的伊成器博士,是2016年药明康德生命化学研究奖获奖者中最年轻的一位。从中国科技大学本科毕业后,他仅用六年半时间就在芝加哥大学完成了博士和博士后的学习和训练,并在2012年获得IUPAC(国际纯粹与应用化学联合会,全球化学命名权威)青年化学家奖;在2016年收获年度中国化学会青年化学奖。对于自己所取得的成绩和效率,伊博士表现出超乎年龄的成熟,他非常淡然地说道:“我只是在几个关键的时间点,比一些同仁幸运,也有幸遇到了非常优秀著名的导师;学业进程中一时的快慢,并不代表绝对的好坏。成功与失败,幸运与挫折,都只是生活的一部分。”
名师启蒙,享受科研
药明康德:在人类基因组计划完成之后,随着高通量测序技术发展,表观遗传学和表观转录组学随之兴起。在成长求学的过程中,您是如何与这个研究方向结缘的?
伊成器博士:我在芝加哥大学攻读博士和从事博士后工作花费的时间,可能比一些同龄人要稍微短一点,所以建立实验室独立开展工作,也比一些同仁要早一点。
读完本科之后,父母觉得男孩在年少时如果能有海外的求学阅历,可以让全身心得到更好的历练。我在2005年顺利地被芝加哥大学录取,有幸师承博导何川教授。2013年美国霍华德休斯医学研究院(HHMI)宣布的全美27位顶尖生命医学学者就包括何川老师,他也是唯一入选的华人学者。在何川老师的课题组,我接受到了系统的化学生物学训练。除了完成具体课题、了解科研知识,他的许多教导让我终身受益:将化学知识手段运用到实际的生物学体系中,才能解决关键、重大生物学医学问题。另外何川老师也在我的专业选择中起到了非常重要的影响。他开拓了表观转录组学这样一个新兴的领域,是我系统科研的启蒙人。
▲何川教授(图片来源:北京大学)
在博士后导师潘滔教授的课题组,我又接受了系统的RNA生物学训练,这对我现在的课题组帮助很大。虽然在博士后期间,我的工作和生活都更加忙碌,因为除了完成当时的实验,还要思考未来独立工作的方向。
▲潘滔教授(图片来源:芝加哥大学)
名师的教导让我学会了如何享受科研,并且产生一些看似不可能实现的科研方法,因为你会发现即使再有挑战的想法,只要认真去做也许都是可以成功实现的。
药明康德:名师教给您的科研方法为您带来了哪些成果?成功的背后,在您的学术工作又有哪些难忘的挫折和挑战?
伊成器博士:2015年我们的团队第一次在《Nature Chemical Biology》杂志在线发表论文,主题是绘制人和小鼠细胞转录组中假尿嘧啶RNA修饰的谱图。假尿嘧啶RNA修饰是100多种已知的生命体转录组修饰之一,这种修饰在多种非编码上功能与机制已有较多研究;然而,对于信使RNA的假尿嘧啶分布和潜在生物学功能知之甚少。最主要的难题,就是如何实现假尿嘧啶在mRNA上的精准定位。
这个课题是我们团队很早选定的研究方向之一,但是哈佛、麻省理工、斯坦福也有团队专攻此课题,并领先我们于2014年在《自然》、《细胞》等顶级学术期刊上发表了重要成果。这给我的团队带来了巨大的冲击,但是我们没有气馁,顶住了所有的压力。
▲伊成器博士的团队在《Nature Chemical Biology》发表文章
最终我们利用小分子化合物特异性标记与富集手段,发展了CeU-Seq假尿嘧啶高通量测序技术,实现人细胞系以及小鼠(大脑与肝脏组织)全转录组水平单碱基分辨率假尿嘧啶检测。最后我们这篇论文获得了比国外团队更好的数据、更多的发现。此外,我们证实了与线粒体脑肌病、先天性角化不良症等疾病相关的PUS1、DKC1两种酶,就属于修饰mRNA的假尿嘧啶合成酶家族;我们还发现转录组中假尿嘧啶的含量与分布,均会受到各种环境刺激的调控,呈现出“刺激条件特异性”的诱导修饰。
开拓表观遗传学新航路
药明康德:请您介绍一下自己的学术研究的主要方向。能否结合您多年的学术经验,谈谈表观转录组学的重要性和应用价值?
伊成器博士:我们的团队主要致力于通过灵敏、高效的检测手段的建立,对核酸修饰的产生及调控过程进行研究,并对其生物功能进行阐述。具体的研究内容包括:(1)表观基因组学和表观转录组学;(2)新颖RNA修饰对小分子RNA(microRNA)及长链非编码RNA功能的影响及机理;(3)碱基切除等DNA修复通路在防止细胞衰老及癌变过程中的分子机制。
表观遗传学的机制有很多种,可以通过组蛋白修饰,也可以通过甲基化来发挥调节作用。核酸的化学修饰对许多重要生命过程都有着广泛而深远的影响,比如5-甲基胞嘧啶及其氧化产物对基因表达及细胞发育过程的影响、RNA编辑对选择性剪接及蛋白质翻译过程的影响等等。另一方面,异常的核酸修饰(比如DNA及RNA损伤)则会导致细胞衰老、死亡及致癌性变异等严重后果。
在宏观层面,表观遗传学能从基础学科角度,阐述诸多疾病的发生机制。同样,表观转录组学作为一个新兴学科,也与一些重大疾病存在十分密切的关联。所谓“表观转录组学”是研究对于DNA转录产物RNA的表观修饰。研究RNA修饰的功能和调控机制,把“表观转录组学”所涉及关键基因鉴定出来,它们有望成为未来临床的药物靶点。另一方面,表观转录组学研究,可能也有助于疾病诊断的生物标记物的发现,可用于预后或用药指导。
药明康德:如您所言,这个领域的学术成果有哪些具体的转化医学前景,未来是否可能与癌症免疫基因疗法、辅助生殖等实现交叉促进的?
伊成器博士:基于现有的RNA测序平台,我们还在不断开发更先进的测序技术,也许将来能应用于其他实验室。从现实转化医学方面突破口来讲,最新的高通量测序技术也在积极应用于真实生物学样品,如癌症病人的血液,也许未来可以应用于癌症病人的液体活检,从而在早期能够诊断癌症。
另外在癌症治疗方面,传统的化疗、放疗就是为了杀伤癌症细胞基因组。如果我们知道基因损伤修复的机制,哪种蛋白、何种酶对其进行修复,则我们可在损伤癌细胞的基因时,也对癌细胞的修复通路进行阻碍,这样就能够选择性和特异性地杀死癌细胞。
“表观转录组学”是一门非常前沿的科学,我们在开展工作时,需要综合多学科的方法和手段,如生物学、化学和医学等多学科交叉来完成高水平研究。我所在的北大一直有兼容、开放和自由的优秀传统,既鼓励广大科研人员按照自己的兴趣探索喜爱的前沿领域,我们实验室又可充分利用综合性大学的优势,咨询与科研相关的其他领域内专家,从不同的基础学科出发形成组合拳的优势,推动生物科学的发展。
幸运与挫折,都是经历
药明康德:能否描述一下您的标准工作日?多年的实验室奋斗中,您是否有可以和学生以及普通人分享的座右铭?
伊成器博士:工作时间很弹性,但是一周的工作时间会达到90小时左右。关于科学探索的精神理念,一定要脚踏实地。不论是理论学习还是动手实践,兴趣的产生通常让人感到兴奋;然而我们无法否认的是,科学实验的过程中,可能许多所谓灵感和设计,最终都会以失败告终。这么高的失败率,一位科研工作者如何保持清醒的头脑和镇定的气场?
幸运的兴奋感常常转瞬即逝,而失败的痛苦和挫折感却常常挥之难去。我们必须懂得成功和失败都只是生活的一部分。荣誉只是阶段性的成果,背后是远远超过荣誉的失败经历。不论科研,还是其他的工作与生活,没有人可以逃避挫折,所以我们千万不要把挫折与科研探索等同,它只是所有人工作和生活的一部分。幸运与挫折,都是人生的修行之路。
▲伊成器博士
药明康德:对于您自己的科研方向和国家整体的新药创制格局,您有哪些具体的展望和期待?
伊成器博士:北大为我这样的青年科研工作者提供了资助,帮助我建立了自己的独立实验室,因为各种偶然和客观的因素,因为赶上了很好的时代背景和机遇,所以能有所成绩。
如今中央层面充分重视基础科学作为创新原动力的作用,所以现在是做科研非常好的时期。我非常希望将个人发展与国家大方针政策格局结合,在国家重视医药产业原创技术创新的大背景下,实现更多的实验室创新成果。
在转化医学方面,我也很愿意与大企业有更多的机会沟通互动,因为药企对于转化医学的具体方向有更为敏锐的捕捉触角,我非常希望与产业界的精英们进行定期或者不定期的交流,减少学术单位与产业对接的信息不对称,从而加速创新成果转化。
本文来自药明康德微信团队,欢迎转发到朋友圈,谢绝转载到其他平台。如有开设白名单需求,请在文章底部留言。如有其他合作需求,请联系wuxi_media@wuxiapptec.com。
癌症突破
抗癌疫苗 | 癌症地图 | KRAS | 酒精 | CAR-T 2.0 | 单细胞CAR-T | 外泌体 | 白血病免疫疗法 | 膳食纤维与肝癌 | 中年危机 | 液体活检 | 化疗与癌症转移 | 抽烟喝酒要不得 | 癌症转移 | 癌细胞变脂肪 | 自噬反应
智慧之光
大脑逻辑 | 母爱 | 脑细胞 | 阿兹海默病血检 | 孤独 | 可乐 | 生酮饮食 | 阿兹海默病毒假说 | 大脑抗衰老 | 麦克阿瑟天才奖 | APP蛋白 | 畅游大脑 | 细菌感染假说 | 睡眠与心血管疾病
热门前沿
膳食纤维 | 人工智能 | 耐寒 | 维生素D | 脂肪治疗 | 细菌耐药 | 性别逆转 | 延年益寿 | 细胞分裂 | 减肥新方 | 单染色体酵母 | 吃不胖的方法 | 精准医学 | 单性生殖 | 胚胎发育 | 基因疗法 | 蚊子吃减肥药 | AI医生 |长寿天然分子 | 细胞排除废物 | 大道至简
http://weixin.100md.com
返回 学术经纬 返回首页 返回百拇医药