【公开课预告】 微生物活性化合物的高通量定向挖掘与活性评价
2022/9/16 10:36:48 生物密探

    

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     天然产物一直以来都是药物先导化合物的重要来源。但近年来,天然产物药物的研发却逐渐陷入低潮,其中主要问题之一在于传统植物资源中,仅仅利用传统的分离分析方法获取新的天然产物已经无法满足药物发展的需求,新化合物的发现越来越困难。微生物在自身生长发育过程中能够产生多种活性次级代谢产物,这些产物由于其多元的化学结构与广谱的生物学活性,在人类健康、农业、畜牧业等领域发挥了重要作用。因此,微生物资源的开发在天然产物药物的研究发展中起着越来越重要的作用。

     近年来,随着DNA测序技术和生物信息学的快速发展,越来越多基因组数据被公布,伴随着高通量测序方法的发展,各种基因组挖掘方法和工具也被开发出来以指导发现和表征这些天然产物。然而,包括笔者在内,众多科研工作者对这一领域还是有些陌生。

     本周末的钰沐菡公开课,有幸邀请到上海交通大学李雷副教授,他将首先向我们介绍微生物活性化合物定向挖掘的研究背景,随后介绍长读长测序驱动的宏基因组挖掘与利用全新基因组挖掘(结构基序搜寻预测的非核糖体肽数据库)这两种新颖的天然产物高通量发现方法,并展示根据这两种方法鉴定的多个具有独特作用机制与新颖结构骨架的抗感染先导化合物。

    

     李雷 老师

     2022年7月入职上海交通大学生命科学技术学院,担任长聘教轨副教授,博士生导师,课题组组长。2017年于中国科学院分子植物科学卓越创新中心获得博士学位。先后在中科院分子植物科学卓越创新中心、美国洛克菲勒大学从事博士后研究。目前以第一或通讯作者在Nat Microbiol、Metab Eng与Biotechnol Adv等学术期刊发表SCI论文15篇,详见https://life.sjtu.edu.cn/teacher/LeiLi。

     主持“博士后创新人才支持计划”等4项国家或省部级科研项目。课题组研究方向为微生物天然药物化学与合成生物学,致力于开发天然药物(宏)基因组定向挖掘新方法与高效制造新一代合成生物技术,以期解决以下三方面关键科学或技术问题:1)新结构骨架或作用机制活性天然产物匮乏;2)微生物药物发酵单位低与同系杂质多;3)工业菌基因组不稳定与遗传操作困难。课题组依托微生物代谢国家重点实验室,拥有充足的经费支持,常年招聘具有不同学科背景的本科生、研究生与博士后加盟。

     参与方式

     日期:2022年9月18日

     时间:北京时间19:00

     直播平台:ZOOM

     会议 ID: 864 1382 1684

     会议链接:

     https://us02web.zoom.us/j/86413821684

    

    

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